متدولوژيك (روش شناخت) ديني، فرهنگي و سياسي آن كار كرده و بنياني را گذاشته است كه در آينده همچنان راهگشاي دوست داران مباحث انقلابی جهان اسلام خواهد بود. شهيد مطهري پس از روشن كردن بناي متدولوژيك بحث خود به ايجاد بنيادهاي انقلابی پرداخت و سپس وارد حوزه اجتماع و فرهنگ شد و در نهايت به نتيجه مورد نظر خود که تحت رهبری امام خمینی (ره) بود، دست یافت. در این باره دکتر رمضان شعبانی سارویی، نویسنده ده‌ها کتاب در حوزه اندیشه و افکار استاد مرتضی مطهری می‌گوید:

شهید مطهری از جمله اندیشمندان و تئوری پردازان انقلاب اسلامی بود که منشاء آثار و برکات گوناگونی برای انقلاب و برپایی نظام مقدس جمهوری اسلامی محسوب می‌شود. در اندیشه های امام خمینی از شهید مطهری با عنوانِ چهره ای کم نظیر، حاصل عمر، استثناء و فردی که دارای قلمی روان و فکری توانا در تحلیل مسایل اسلامی داشته است، یاد شده و در گفتار مقام معظم رهبری نیز به عنوان نادره دوران و زمانه از استاد شهید ذکر شده است. این ویژگی‌ها و خصوصیات اخلاقی بی شک نشان دهنده این است که در حقیقت شهید مطهری یک چهره ویژه برای برپایی و پیدایش انقلاب بود و از این رو آثار شهید و تایید حضرت امام، خود مهر تاییدی بر نقش و عامل تمایز وی با سایر انقلابیون و اندیشمندان معاصر می‌باشد. آثار شهید هم دارای جامعیت است و هم در برگیرنده طبقات گوناگون جامعه، چنانکه این مهم را می‌توان از داستان راستان تا منظومه ملاهادی سبزواری مشاهده کرد و در این بین صحت آثار شهید، جای تامل دارد، چراکه حتی کوچکترین رگه هایی از انحراف که در برخی از اندیشمندان و متفکران معاصر با مطهری گاه دیده می‌شد، وجود ندارد.

این پژوهشگر در ادامه بیان داشت: بی شک آن چیزی که در شرایط فعلی می‌بایست آن را مورد توجه قرار داد، نگاهی ریزبینانه به شرایط پیشرفت ایران است، چرا که با گذشت 4 دهه از پیدایش انقلاب اسلامی و بنا به تعبیر مقام معظم رهبری، اکنون جامعه به مطهری های بسیاری نیازمند است. البته باید به این نکته توجه داشت که پیوسته خط فکری و عملی شهید مطهری ادامه یافته است؛ چنانکه پس از نایل شدن استاد مطهری به مقام والای شهادت، جمعی به امام خمینی (ره) مراجعه کرده و در خواست مشخص نمودن جانشینی برای بر عهده گرفتن نقش استاد مطهری در دانشگاه‌ها را کردند. سپس امام در پاسخ به آنان فرمودند بروید به سراغِ حضرت آقای سیدعلی خامنه‌ای.

 این نکته ای بسیار عمیق است که اگر امروز ما استاد مرتضی مطهری را از دست داده ایم، مطهری دوران ما حضرت آیت ا... خامنه ای است که باید از مکتب فکری، فرهنگی و اندیشه‌ها و رهنمودهای ایشان بهره مند شده و در واقع راه امام خمینی (ره)، راه شهید مطهری و گفتمان انقلاب اسلامی با اندیشه‌ها و نکات حکیمانه مقام معظم رهبری در حالِ استمرار است و از این رو در عصر حاضر ایران در  اوج و تلالو و پیشرفت انقلاب اسلامی قرار دارد و نفوذ این افکار و اندیشه‌ها در فضای منطقه ای را شاهدیم که بی شک این مساله مبتنی بر زیر ساخت هایی می‌باشد که به وسیله استاد مطهری بنیان نهاده شد و امروزه به روز نمودن و متناسب سازی آن زیرساخت‌ها با نیازهای زمانه در کلام حضرت آیت ا... خامنه ای جلوه کرده و تفسیر گفتمان مکتب شهید مطهری در اندیشه رهبر عظیم الشان انقلاب تجلی یافته است.

دکتر شعبانی سارویی همچنین خاطر نشان کرد: از دیگر ویژگی‌های شاخص شهید مطهری شناسایی و آگاهی کامل داشتن بر ویژگی‌های زمانه بود، چرا که وی در فضای فکری، فرهنگی، سیاسی و مبارزاتی دانشگاه و حوزه حضوری فعال داشت و به بهترین نحو بر این شرایط تسلط و اشرافِ اطلاعاتی داشت و بر اساس همین نگاه، بخش اعظمی از آثار استاد در بردارنده جریان های مادی گرایی، التقاطی و الحادی می‌باشد که در آن مقطع شهید از آن‌ها با عنوان خطر برجسته یادکرده است و سرانجام استاد مطهری نیز قربانی کینه توزی همین جریان‌ها شد؛ چراکه چنان گسترده این جریان‌ها در حال رسوایی بودند که چاره ای جز از صحنه خارج ساختن استاد مطهری را نداشتند و سرانجام نیز گروهک فرقان بر این حرکت ناجوانمردانه و اسلام ستیزانه اقدام نمود.

این مدرس دانشگاه بیان داشت: شهید مطهری بی شک قربانی جریان‌های انحرافی و بویژه جریان نفاق شد، به نحوی که فضای آن زمان گونه ای خاص از نفاق را در خود داشت و امروزه نیز این جریان با رویکردی جدید در حالِ جریان است که با نوعی از تفکرات سکولاریزمی در فضای فکری-سیاسی و فرهنگی جامعه در حال شیوع و نفوذ است و هرچه زودتر باید بر این شرایط غالب آمد؛ چراکه بی شک ثمره آن قربانی شدن اندیشمندان و فعالان عرصه فرهنگی خواهد بود.

با این حال استاد مطهری با اطلاعات گسترده خود از تمامی جریان‌های موجود به خوبی توانست به نقد آن‌ها بپردازد، چنانکه در آثار مکتوبِ خود به نحوی بسیار شایسته به این موضوعات پرداخته است و آسیب هایی که این جریان ها در دهه 40 و 50 نسل فعالِ جامعه را تهدید می‌نموده است، تبیین و تشریح کرده است که بی شک این توانمندی علاوه بر ممارست در کسب علوم، منشأ گرفته از ویژگی های روحی و معنوی ممتاز استاد از جمله طهارت روح می‌باشد.

نویسنده کتاب اندیشه مطهر افزود: استادِ شهید پیوسته با بیان تئوری‌های انقلابی و مباحث فکریِ اسلامی در بین اقشار گوناگون جامعه، هم در زمینه سیاسی و هم در زمینه فرهنگی، آنان را با آسیب‌ها و چالش هایی که بواسطه افکار مسموم در حال نشر بود آشنا ساخت و بی‌تردید یکی از دلایلی که پس از انقلاب این جریان‌ها توانایی رشد در جامعه را نیافتند را باید در این بستر سازی‌ها دانست، چنانکه این امر را می‌توان ثمره آثار مکتوب و نشر گسترده آن در میان اقشار مختلف دانست به نحوی که امروزه مردم با بهره گیری از اندیشه و افکار امام خمینی (ره)، شهید مطهری و حضرت آیت ا... خامنه ای به عنوان سه ضلع اصلی نظام ولایی ایران، در مسیر جامعه ای انقلابی و اسلام محور گام برمی‌دارند.